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3D メッシュ/モデル PDB ファイルを X3D に変換します

当社の無料で高速なツールは、ほとんどの 3D メッシュまたは PDB (Protein Data Bank) モデル ファイルを標準の X3D (Extensible 3D Graphics) ファイルに変換します。このファイルは、Blender や 3Dプリントそれ以上の処理は必要ありません。私たちの変換ツールは、複数の PDB ファイルをバッチ変換することもできます。一度に最大 25 ファイルを変換できます。

PDB ファイルを変換するには、上の [アップロード] ボタンをクリックし、変換するファイルを選択します。選択すると、ファイルは X3D ファイルに変換され、すぐにダウンロードできるようになります。 PDB から X3D への変換プロセスの詳細については、「 変換情報セクション下に。

オンラインで PDB を X3D に変換するにはどうすればよいですか?

PDB を X3D に変換する 2 つの簡単な手順を次に示します。

PDB をアップロードします

「PDB ファイルをアップロード」ボタンをクリックし、アップロードする PDB を選択します。最大ファイルサイズは100MBです。

X3Dをダウンロードしてください

完了したらダウンロード リンクをクリックして X3D ファイルを受け取ります。

PDB から X3D までのファイル形式情報

拡大PDB
フルネームProtein Data Bank
タイプ3Dモデル
MIME タイプapplication/octet-stream
フォーマットBinary
ツールPDB コンバーター, 3Dモデルボクセライザー, PDB 個のアニメーションを作成する, PDBを表示する

説明

PDB ファイル形式は、タンパク質分子の構造を記述するために使用されます。正式なタイトルは Protein Data Bank で、その起源は 1976 年に遡り、分子、その構造、および座標などの関連データを保存する手段として使用されました。

形式は平文PDB ファイルは、さまざまな 3D モデリング プログラムや一部の専門ソフトウェアでも開くことができます。

説明

X3D ファイル形式は、3D VRML (WRL) ファイル形式の後継として 2002 年に導入されました。 X3D ファイルには、頂点、面、法線、マテリアル データを使用して定義された 3D メッシュとモデル情報が含まれており、古い VRML 形式と同様に幅広い機能を備えています。

X3D ファイルは構造化されていますXMLテキストベースのファイルを使用すると、フル 3D シーンに 3D メッシュ データやその他の単純な形状で構成されるモデルを含めることができます。 X3D ファイルを HTML 内に直接埋め込み、Web ページに直接レンダリングできるようにするブラウザ拡張機能があります。ただし、この形式は広く採用されていません。

X3D 注記

X3D ファイルはマテリアルとカラー情報をサポートします。アップロードされたモデルにカラー情報が含まれている場合、私たちのツールは変換プロセスの最後にカラー情報を X3D ファイルに保存しようとします。現時点ではテクスチャ情報はサポートされていません。

サポートされている機能

  • メッシュジオメトリ
  • メッシュ素材のカラー
  • 頂点カラー

サポートされていない機能

  • テクスチャ

PDB と X3D の機能の比較

 

PDB 機能

  • メッシュ ジオメトリ (頂点と面)
  • 頂点法線
  • 面法線
  • 頂点カラー
  • 顔マテリアル(テクスチャを除く)
  • テクスチャ
  • 点群
  • ファイルごとに複数のオブジェクト
  • オブジェクトの変換 (移動、回転、スケール)
  • 骨・関節
  • アニメーション
  • 3Dプリントに最適

X3D 機能

  • メッシュ ジオメトリ (頂点と面)
  • 頂点法線
  • 面法線
  • 頂点カラー
  • 顔マテリアル(テクスチャを除く)
  • テクスチャ
  • 点群
  • ファイルごとに複数のオブジェクト
  • オブジェクトの変換 (移動、回転、スケール)
  • 骨・関節
  • アニメーション
  • 3Dプリントに最適

どのように機能するのでしょうか?

PDB ファイル形式から X3D への変換は複雑なプロセスになる可能性があり、この変換プロセスに使用されるツールはさまざまなデータ変換タスクを処理できるだけでなく、3D モデル内の欠陥を特定して修正できる必要があります。彼ら。ここでは、PDB ファイルを有効な X3D 3D モデルに正確に変換するためにツールで使用される変換プロセスについて説明します。変換プロセスから始めましょう。これには次の手順が含まれます。

ステップ 1: ソース PDB ファイルを読み取る

最も単純な形式では、PDB ファイルは頂点、面、法線などの 3D データを含むバイナリ データ ファイルです。これらを組み合わせると、画面に表示される 3D モデルが構成されます。

PDB ファイル形式の詳細については、この優れたドキュメントを参照してください。 記事PDB 形式について詳しく説明しています。

ステップ 2: ファイルデータを処理する

PDB ファイル データが読み取られると、ツールは完全な 3D モデルの内部表現を生成し、発生したジオメトリの問題を修正しようとします。 3D モデルの問題を修復するとともに、ツールは重複した頂点を削除し、モデルを X3D 形式にエクスポートする準備をします。

ステップ 3: X3D 形式で保存する

変換プロセスが最終段階に入り、ツールはステップ 2 で作成したメモリ内 3D モデルを取得し、X3D 形式に変換する必要があります。

よくある質問

PDB ファイルを X3D に変換するにはどうすればよいですか?

まず「アップロード...」ボタンをクリックし、アップロードする PDB ファイルを選択します。設定オプションを選択します。PDB から X3D への変換が完了すると、X3D ファイルをすぐにダウンロードできます。

PDB を X3D に変換するにはどのくらい時間がかかりますか?

私たちは、PDB から X3D への変換をできるだけ早く処理することを目指しています。これには通常約 5 秒かかりますが、より大きく複雑なファイルの場合はさらに時間がかかることがありますので、しばらくお待ちください。

PDB から X3D への変換はどの程度正確ですか?

当社のツールでは、最も正確な変換を実現することを目指しています。当社のツールは継続的に開発されており、毎週新しい機能や改善点が追加されています。

ImageToStl.com で PDB を X3D に変換するのは安全ですか?

はい、もちろんです。当社では、お客様が送信した PDB ファイルを保存しません。作成された X3D ファイルは、アップロード後 15 分で削除され、ダウンロード リンクはこの時間以降に期限切れになります。

PDBからX3Dへのコンバーターを使用するには、高スペックのコンピューターが必要ですか?

いいえ。当社のすべての変換ツールは、専用の変換サーバー上で PDB ファイルを処理するため、低スペックのコンピューター、ラップトップ、タブレット、モバイル デバイスで当社のツールを使用し、変換された X3D ファイルをすぐに受け取ることができます。

Windows、Linux、Android、iOS、Mac OSでPDBをX3Dに変換できますか?

はい!当社の PDB から X3D へのツールは、最新の Web ブラウザを搭載したあらゆるシステムで実行できます。当社の変換ツールを実行するために特別なソフトウェアは必要ありません。

広告ブロッカーを使用している場合、何か影響はありますか?

はい。広告ブロッカーを使用することもできますが、PDB 変換ツールが気に入った場合は、サイトをホワイトリストに登録することを検討してください。広告ブロッカーが有効になっている場合、一部のツールで変換制限が課せられ、処理/変換時間が長くなります。

PDB を X3D に変換するサポートを受けることはできますか?

はい。PDB を X3D に変換したら、「フィードバック」オプションを使用して、ファイルの変換時に発生した問題をお知らせいただけます。

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